默认设置通过禁用任何现有的 CodeQL 工作流并阻止任何 CodeQL 分析 API 上传来覆盖已有的 CodeQL 配置。此行为会阻止您在仅使用默认设置结果时，使用 GitHub Actions 的时间来运行 CodeQL 高级设置的工作流。如需了解在高级设置和默认设置之间切换的更多信息，请参阅 结果与预期不符。
可选地，如果您确定不再需要先前的工作流文件，可以从存储库中删除该文件。如需了解更多信息，请参阅 在仓库中删除文件。
在某些情况下，您的仓库可能使用多个代码扫描配置。这些配置可能会产生重复的警报。此外，不再运行的过时配置会显示过时的警报状态，而且这些过时警报会无限期保持打开状态。为避免过时警报，您应从分支中移除过时的代码扫描配置。有关多个配置以及删除过时配置的更多信息，请参阅 关于代码扫描警报 和 解决代码扫描警报。